Preobčutljivost za mleko prizadene manj kot 1 odstotek odraslih in približno 2 do 5 odstotkov otrok. Po navedbah klinike v Clevelandu je intoleranca za hrano posledica nezmožnosti telesa, da bi razgradil sestavino hrane, kot je beljakovina. Kazein in sirotka v mlečnih beljakovinah sprožijo odziv prebavnega sistema, ki pri posameznikih z intoleranco za mlečne beljakovine povzroči prebavne simptome.
Kri v blatu
Nestrpnost mlečnih beljakovin lahko povzroči vnetje v debelem črevesju in danki, kar ima za posledico krče, ki se pretakajo v krvi. Takšno stanje imenujemo proktitis ali proktokolitis in se pojavlja pri dojenčkih, je povedal dr. Alan M. Lake, izredni profesor pediatrije na Medicinski šoli univerze Johns Hopkins. Lake navaja, da se ta simptom navadno kaže med 2. in 8. tednom starosti in se odpravi v treh dneh po odpravi izpostavljenosti mlečnim beljakovinam. Približno 95 odstotkov prizadetih dojenčkov bo lahko prenašalo uživanje mlečnih beljakovin do devetega meseca starosti, pravi Lake.
Zaprtje
Čeprav se pogostost gibanja črevesja lahko razlikuje od posameznika do posameznika, klinika Mayo navaja, da lahko manj kot tri gibanja črevesja na teden kažejo na zaprtje, prav tako tudi prehod trdega in suhega blata. Nestrpnost mlečnih beljakovin je povezana s kroničnim zaprtjem. Raziskovalka Silvia Daher in sodelavci so v številki o otroški alergiji in imunologiji decembra 2001 poročali, da je 28 odstotkov otrok, ki so preučevali kronično zaprtje, doživelo normalno gibanje črevesja, ko so beljakovine kravjega mleka izločili iz prehrane.
Gastroezofagealni refluks
Regurgitacija želodčne vsebine v požiralnik, znana kot gastroezofagealni refluks, je lahko posledica intolerance na beljakovine mleka. Do 40 odstotkov dojenčkov, ki trpijo zaradi gastroezofagealnega refluksa, so intolerantni na mlečne beljakovine, pravi dr. Harland S. Winter, izredni profesor pediatrije na Harvard Medical School. Prizadeti posameznik lahko občuti pekočino v prsih in grlu, kašelj, piskanje in težave pri požiranju. Dojenčki lahko tudi zavrnejo jesti.
Driska
Nestrpnost za mlečne beljakovine lahko sproži vnetni odziv v tankem črevesu, imenovan enteropatija, ki moti absorpcijo in povzroča drisko. Najpogosteje se pojavi pri dojenčkih, ki jim je bilo kravje mleko dano pred 9. mesecem starosti. Ko je prizadet celoten sistem prebavil, se stanje imenuje enterokolitis, ki ga povzroča mlečni protein.
Bruhanje ali pljuvanje
Bruhanje se pojavi tudi z enteropatijo, ki jo povzroča mlečna beljakovina in enterokolitis. Običajno se začne v dveh do štirih urah porabe beljakovin mleka in lahko vodi do močne dehidracije. Pogosto izlivanje pri dojenčku lahko kaže na gastroezofagealni refluks, ki ga povzroča intoleranca za mlečne beljakovine.